Download ECの運営代行おすすめ12社をまとめて紹介！
選び方も解説

ECサイトの売上拡大を目指す中で、専門知識の不足や人的リソースの限界、マーケティング施策の行き詰まりなど、様々な課題に直面していませんか。

そこで注目されているのが、EC運営業務をプロフェッショナルに委託する「EC運営代行サービス」です。

本記事では、初心者でも利用しやすい支援プランから、売上238%UPを実現した実績企業まで、厳選した12社を徹底比較しています。

さらに、月額固定費型と成果報酬型の違い、AI活用への対応力、サポート体制の確認ポイントなど、失敗しない代行会社の選び方も詳しく解説します。

EC運営代行会社おすすめ一覧

EC運営の専門知識やリソース不足に悩む企業にとって、運営代行サービスは売上拡大の強力なパートナーとなります。

ここでは、初心者でも利用しやすい支援プランを持つ代行会社や、中小企業のEC成長を得意とする会社を厳選して12社紹介します。

各社の詳細は記事後半で詳しく紹介しています。自社のニーズに合った運営代行会社を見つけ、EC事業の成長を加速させましょう。

EC運営代行とは

EC運営代行とは、自社のECサイト運営に関する業務を専門会社に委託するサービスのことです。以下のような日々の運営業務をプロに任せることで、効率的な事業運営が可能になります。

【委託可能な業務（例）】

• 商品登録・在庫管理
• 受注処理・顧客対応
• 集客・マーケティング
• サイト改善・広告運用

これらの業務を一括サポートする包括的なプランを展開しているサービスもあります。

自社で対応しきれない業務を外部に委ねることで、運営負担の軽減と売上拡大を図れるでしょう。特に、中小企業では、社内リソースを戦略立案や商品開発などのコア業務に集中させることで、効率的に事業成長を促進できます。

EC運営代行会社は、最新のECトレンドやプラットフォームの仕様変更にも迅速に対応し、常に最適な運営環境を提供してくれます。

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EC運営代行を利用するメリット

EC運営代行を利用することで、以下の4つの主要なメリットを享受できます。

1. 専門知識の活用

専門知識を持つプロが対応するため、最新ノウハウを活かしたサイト運営が可能になります。

ECプラットフォームのアルゴリズム変更や新機能への対応、効果的な広告運用など、日々更新される情報をキャッチアップし続けることは容易ではありません。

2. リソースの最適配分

人的リソースや時間を節約でき、本業の戦略立案や商品開発に集中できます。EC運営には、以下のような多岐にわたる業務が発生します。

• 商品撮影・ページ制作
• 在庫管理・受注処理
• カスタマーサポート
• データ分析・レポート作成

3. 売上向上の実現

運営代行会社のサポートにより売上や集客の強化が期待でき、成果に直結しやすいです。

代行会社によっては、AIの活用により「多様な顧客ニーズ」や「集客チャネル」に合わせた販売促進を可能にしています。レコメンドエンジンの導入や動的価格設定など、最新技術を活用した施策も実装できます。

4. コスト効率の向上

人件費の固定負担を抑制でき、必要な業務だけを柔軟に委託することでコスト効率も向上します。

繁忙期と閑散期に応じた柔軟な対応が可能となり、固定費を変動費化することで経営の安定性も向上させられます。

ECサイト運営代行おすすめ12社

ここからは、豊富な実績と専門性を持つ代行会社を中心にピックアップし、それぞれの強みやサービスの特徴を解説します。

特色あるサービス内容や実績を詳しく紹介しますので、自社のニーズに合っているか検討するときの参考にしてください。

株式会社東通メディア

株式会社東通メディアは「通販マーケッターGrowth!」というEC運営代行サービスを提供しており、以下のような強みや特徴があります。

• システム利用顧客の平均成長率290%という驚異的な実績
• 通販現場の経験豊富なスタッフによる手厚いサポート
• 広告代理業・コールセンターなどトータルサポート体制

システムとEC運用代行を組み合わせることで、効率的かつランニングコストカットを実現。年商5〜10億円でも対応可能な機能性や拡張性のあるシステムを提供し、定期購入や頒布会など通販に特化した機能が標準搭載されています。

最高水準のセキュリティ対策も実施しており、中小企業が安心して利用できる環境を整えています。引継ぎに必要な業務負荷を最小限に抑え、スムーズな導入が可能です。

アートトレーディング株式会社

アートトレーディング株式会社は、ECビジネスにおいて制作・運営・コンサルを長年経験しているプロ集団です。

サービスの特徴

• 制作から運営、物流まで一貫対応
• mylogi＋フルフィルメントによる物流支援
• 楽天市場やAmazonでの豊富な運営実績

「売れる喜び、お客様の笑顔を引き出すあなたのパートナー」というビジョンのもと、単なる業務代行にとどまらず、クライアントのビジネス成長を真剣に考えたサポートを実施しています。

物流パートナーとの連携により、商品の保管・配送まで含めた包括的なサポートが可能。特に物流面での課題を抱える企業にとっては、フルフィルメントサービスを含めた総合的な支援が受けられる点で大きなメリットがあります。

長年の経験により蓄積されたノウハウを活かし、各クライアントの課題に応じた最適なソリューションを提案します。

株式会社Proteinum（プロテーナム）

株式会社Proteinumは、経営コンサル、楽天、Amazonブランド出身者によって構成されるEC事業特化のコンサルティング会社です。

「施策効果を定量データに基づき正しく分析し、改善を行うというPDCAを高速回転できるかどうか」という考えのもと、以下のサービスを提供しています。

• 戦略構築・データ分析
• 集客対策・ECサイト制作/運用
• ECサイト初期構築・利益改善サポート

「ECの発展になくてはならない存在になる」を企業理念とし、データドリブンな改善提案で確実な成果創出を目指しています。

大手ECプラットフォーム出身者が培ってきた実践的なノウハウを提供し、効果検証に基づく改善施策を高速で実施。ECコンサルティング・運営代行事業とDtoC事業の両軸で事業を展開し、実践と理論の両面からクライアントをサポートしています。

コマースメディア株式会社

コマースメディア株式会社は、東京と福岡を拠点にShopifyの制作・運営代行を中心に展開しています。

主な実績と強み

• 日本で3社目のShopify Experts企業
• Shopify Premier Partner認定
• Shopify E-commerce Awards 2019受賞

サイト制作から運用・物流までトータルサポートが可能で、以下のような一貫したサービスを提供しています。

1. 戦略策定
2. サイト構築・更新
3. 運営・受注代行
4. 物流代行・カスタマーサポート

Shopifyだけでなく、楽天市場やAmazonなどのモール店舗の運営実績も豊富。越境を含めた各モールの自社事業サイトも運営し、この実践経験を活かした迅速かつ万全の対応力が強みです。

フルサポート支援とスポット支援の両方に対応可能で、クライアントのニーズに応じた柔軟なサービス提供も特徴と言えるでしょう。

株式会社スタイリスト

株式会社スタイリストは、2016年3月創業のECサイト運営代行会社で、圧倒的な運営実績を誇ります。

主な運営実績

• 楽天市場：月商4.5億円
• Amazon：月商3億円
• Yahoo!：月商1億円
• 5年連続15部門受賞
• 150以上のコンサルティング実績

また、以下の部門を有しており、EC運営代行の大部分を「自社内で完結」できています。

• コンサルティング部門
• 広告代理店部門
• 受注発注CS部門
• クリエイティブ部門
• エンジニア部門

「最先端で無機質なTechnologyに強い会社ではなく、人を介したExpressionとOperationに原点を置く会社」という理念のもと、属人的であることを強みとして捉えています。

一気通貫した運営代行により、クライアントの売上と利益拡大にコミットする姿勢が特徴です。

株式会社ワンプルーフ

株式会社ワンプルーフは、EC業界のリーディングカンパニーとして圧倒的な実績を持つ企業です。

主な実績データ

• クライアント総数：90社
• クライアント流通総額：2000億円
• ECプロフェッショナル人財数：200名
• フルフィル倉庫数：16拠点
• ECソリューション数：90

主要クライアントには、クリンスイ、アンダーアーマー、ミレー、レッドブル、ガーミンなど国内外の有名ブランドが名を連ねています。

また、サービスは3つの領域で展開中です。

1. フロント領域：マーケティング、デザイン、撮影など
2. バックヤード領域：受注処理、在庫管理、物流など
3. 全領域トータルサポート：EC事業全般の包括的支援

2025年5月には「Top E-Commerce Business Development Solutions in Japan 2025」を受賞し、国際的にもその実力が認められています。

Hameeコンサルティング株式会社

Hameeコンサルティング株式会社は、モバイルアクセサリー市場で高いシェアを持つHameeグループの一員として、スマートフォン関連商品を中心としたEC運営支援を提供しています。

サービスの特徴

• モバイル関連商品のトレンド分析に精通
• 商品企画から販売まで一貫サポート
• グローバル展開の豊富な実績

自社ECサイトの成功経験を基に、特にガジェット・デジタルアクセサリー分野での専門性を活かしたサービスを展開。新商品開発のアドバイスやトレンド分析に基づいた商品提案など、上流工程からの支援が可能です。

デジタル商品の特性を理解した撮影技術や、商品の魅力を最大限に伝えるコンテンツ制作にも定評があります。AR技術を活用した商品体験の提供など、最新技術の導入にも積極的です。

海外市場への進出を検討している企業にとっても、グローバル展開の実績を持つ頼れるパートナーとなり得るでしょう。

株式会社arounds（アラウンズ）

株式会社aroundsは、北海道札幌市を拠点に全国展開する、17年の実績を持つ老舗EC支援企業です。

主な実績と特徴

• 実績：17年
• 取引社数：500社以上
• 運営継続率：85%（2022年度実績）

専属のディレクターが各分野専門のスタッフと連携を図り、以下のようなサポートを提供しています。

• ノウハウを活かした課題解決案
• 最新技術の実装
• 細かなフォローによる運営支援

専門チームが独自の売れる仕組みを設計し、課題点を洗い出して売上目標に応じた施策を実行・検証を繰り返します。この継続的な改善により、各クライアントにとって効果的な売れる仕組みを確立していきます。

「共に考え、共に悩み、共に笑い、共に成長」をキーワードに、単なるサービス提供者ではなく、クライアントの成長パートナーとしての立ち位置を重視。85%という高い運営継続率が、サービス品質の高さを証明しています。

サヴァリ株式会社

サヴァリ株式会社は、2007年から15年以上の実績を持つEC運営代行のプロフェッショナル企業です。

「EC成功の3条件」（商品力・ノウハウ・人材）を基軸に、店舗ごとの課題に合わせた充実したサポートを提供しています。

主な実績

• 累計支援3,000社突破
• 平均売上238%UP達成
• 継続率92.2%
• EC支援企業のBEST100「運営代行部門」選出

契約前に無料の「戦略会議」を実施し、現状分析・課題抽出・年間売上シミュレーションを作成しています。

楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピング、Wowma!、自社ECに対応し、代表をはじめ楽天ECコンサルタント経験者が多数在籍。集客・接客・増客の3要素を全てカバーし、店舗様ごとに完全オリジナルの売上アップ戦略を提案してくれます。

成功事例として、株式会社門崎（格之進）では初のEC展開を成功に導き、ゼリアヘルスウェイ株式会社では売上停滞から120%達成まで回復させるなどの実績があります。

YUGETA ECコンサルティング

YUGETA ECコンサルティングは、楽天市場の店舗コンサル最前線で成果を出し続けてきたメンバーが集う、独自のポジションを確立した企業です。

主な実績

• 月商350万円→2年で月商3.5億円達成
• 楽天SOY（ショップオブザイヤー）のべ15回獲得
• 月商1億円以上のネットショップ30店舗以上コンサル
• 約20名のコンサルタントで合計3,000社の経験

独自の料金システム

• 契約料：クライアントが自由に決定（月額10〜200万円、平均30万円）
• 契約期間：1ヶ月の自動更新
• 初期費用・解約金：なし

この透明性の高い料金体系により、2016年の設立以降、高い契約継続率を維持。対応モールは楽天市場、Yahoo!、Amazon、自社サイトで、不得意ジャンルはないという自信を持ってサービスを提供しています。

課題抽出からコンサルティング/運営代行まで、すべてを専任担当者が行う一貫体制も強みです。

株式会社ロルエージェント

株式会社ロルエージェントは、楽天市場の運営代行とコンサルティングを専門とする、通販の実務経験豊富なスペシャリスト集団です。

企業理念と特徴

• 社名の由来：「lol=lot of laugh（大笑い）」→「笑顔の共有」がミッション
• 2023年3月6日にIT導入支援事業者に認定
• 定期訪問による伴走型サービス

楽天市場の独特な環境での戦い方を熟知し、以下の要素を考慮したオーダーメイド戦略を提案しています。

• 取り扱い商材・価格帯
• 出店年数・会員数
• 予算・スタッフの習熟度

提供サービス

1. 楽天市場ショップコンサルティング：独特の市場での戦い方を伝授
2. 楽天市場ショップ運営代行：月1〜2回の訪問と報告会議
3. デザイン制作：LP・パッケージチラシ等
4. ECスタッフ教育講師：新人から責任者まで網羅した教育プログラム

人材育成に特に力を入れており、経営的にも有益な資産である「人財」の育成を支援します。

アグザルファ株式会社

アグザルファ株式会社は、2011年に業界初でAmazon出品者へのコンサルティングを開始した、Amazon専門のパイオニア企業です。

主な実績

• Amazonランキング大賞受賞
• Amazonマケプレアワード受賞
• Amazon.co.jp販売事業者アワード2022受賞
• Amazon.co.jp販売事業者アワード2023受賞

長年にわたってAmazonコンサルティングの最大手として君臨し「検索結果やランキング1位の獲得」を実現。提供サービスは以下の2つになります。

1. コンサルティング for Amazon
   • Amazon特化の戦略立案
   • ランキング上位獲得ノウハウ
   • 各種アワード受賞支援
2. 広告運用代行
   • Amazon広告の最適化
   • Amazon DSP広告の運用
   • 日々のシステム変更への迅速対応

「個の力の最大化」という理念のもと、＋アルファの価値を創造し、クライアントが持つポテンシャルを最大限に引き出すサービスを提供しています。

EC運営代行会社の選び方・ポイント

代行会社選びで失敗しないためには、自社の現状と目標を明確にした上で、複数の観点から慎重に検討することが重要です。

料金だけで比較するのではなく、以下のポイントを踏まえて「総合的に判断」することが大切です。

• 対応サービス範囲・得意領域を確認
• 料金プランと成果報酬型の有無を比較
• 実績・サポート体制をチェック
• AI活用など最新技術への対応

長期的なパートナーシップを見据えた選定が、EC事業の安定した成長につながります。

対応サービス範囲・得意領域を確認

EC運営代行会社を選ぶ際は、まず対応可能なサービス範囲を確認することが重要です。

【確認すべきポイント】

• 対応チャネル：自社EC、楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピングなど
• 業界特化：ファッション、食品EC、ガジェットなど得意分野の有無
• サービス範囲：越境EC対応、店舗構築支援、物流代行の可否
• 課題対応力：売上拡大、サイトリニューアル、業務効率化など

マルチチャネル展開を視野に入れている場合は、複数のプラットフォームに精通した代行会社を選ぶことで、統一的な戦略実行が可能になります。

業界特有の規制や商習慣に精通している会社であれば、より実践的で効果的な提案が期待できます。たとえば、アパレル業界では季節性への対応力、食品業界では賞味期限管理への理解度が重要です。

「自社が抱えている課題」にマッチした領域を得意とする代行会社を選びましょう。

料金プランと成果報酬型の有無を比較

料金体系の把握は、予算計画と投資対効果の判断において極めて重要です。

成果報酬の計算方法（売上総額か粗利益かなど）や、成長段階に応じた契約変更の可否も確認しましょう。

固定＋成果報酬併用型を採用する会社もあり、自社のリスク許容度や希望に合ったプランを比較検討することが重要です。初期は成果報酬中心、軌道に乗ったら固定費型に移行するなど、段階的な契約も検討できます。

実績・サポート体制をチェック

信頼できる運営代行会社を選ぶには、実績とサポート体制の確認が不可欠です。

【実績確認のポイント】

• 支援社数と契約継続率（80%以上が望ましい）
• 同業種・同規模企業での成功事例
• 具体的な成果数値（売上成長率、CVR改善率など）
• 大手企業の導入実績と評価

【サポート体制の確認項目】

• 専任担当者の有無と経験レベル
• 定例ミーティングの頻度（週次/月次）
• 緊急時の対応体制（営業時間外対応など）
• レポーティング内容と頻度
• コミュニケーション手段の選択肢

過去の成功事例や売上向上の実績を公開している場合は、詳細な内容を確認し、自社に適用可能なノウハウがあるかを判断します。可能であれば、実際のクライアントへのインタビューや詳細な事例紹介も求めましょう。

AI活用など最新技術への対応

EC業界では技術革新が急速に進んでおり、最新技術への対応力は競争優位性に直結します。

【確認すべき技術対応】

• AI活用：レコメンドエンジン、チャットボット、需要予測
• 自動化ツール：在庫管理、価格設定、マーケティングオートメーション
• データ分析：ビッグデータ解析、顧客行動予測、パーソナライゼーション

AIは商品のレコメンド、オンライン接客、在庫管理の最適化など、多くの場面でECサイトの運営に役立っています。これらの技術活用により、ユーザビリティの向上と運営効率化を実現できます。

また、以下の点も確認しましょう。

• 技術研修の実施状況
• エンジニアチームの規模
• セキュリティ対策の充実度
• プライバシー保護への取り組み

最新技術への対応が早い会社は、業務効率化や売上向上の新施策を提案してくれる可能性が高いです。

EC運営代行の活用で自社EC事業を成長させよう

EC運営代行サービスの活用は、自社EC事業を次のステージへ導く重要な戦略的選択です。以下のステップで、EC運営代行を活用しましょう。

1. 自社分析と目標設定

1. • 現状の課題を明確化
   • 優先順位の決定
   • 達成したい目標の数値化
2. 代行会社の選定
   • 本記事で紹介した12社を参考に比較検討
   • 複数社との面談実施
   • 相性と実績の総合評価
3. 契約と運用

• • 業務範囲とKPI目標の明確な合意
  • 定期的なレポート共有とPDCAサイクル
  • 継続的な改善活動

契約時には、役割分担、責任範囲、成果指標、報告体制などを詳細に取り決めることが重要です。曖昧な契約は後々のトラブルの元となるため、十分な協議を行ってください。

EC運営代行サービスを上手に活用し、専門家の力で自社ECの売上拡大と業務効率化を実現しましょう。